在张亚忠看来，富硒特色农业发展面临的主要问题：一是富硒资源家底不清。我国不少省份虽然开展了富硒土地资源调查项目，但受调查比例尺限制，区域性调查评价工作精度不高，精度较高的富硒土地详查工作仅在某些地区展开，调查范围或面积有限，从国家层面，全国富硒土地的分布、数量、质量、结构、农作物适宜性等资源禀赋状况还没有全部查明。二是宣传力度不大，富硒消费市场没有真正形成。目前对富硒农产品的宣传力度不够，导致广大消费者对富硒产品的认识不足，缺乏富硒农产品消费的自觉意识和主观能动性。三是富硒农产品缺少规模化和标准化。富硒农产品缺乏有规模的示范基地或生态园支撑，规模经济效益难以体现；富硒农产品缺乏产品标准，市场上富硒产品良莠不齐，抑制消费者的购买欲望，不利于行业健康和可持续发展。四是我国绿色富硒土地仅占全国耕地面积的3.5%左右，亟须开辟有机硒获取新途径，改良贫硒土壤。
如何发展好富硒特色农业？张亚忠表示，摸清富硒资源家底，为开发富硒产品提供基础性数据。在以往富硒土地初步调查基础上，全面开展富硒土地资源详细调查评价工作，基本查明富硒土地的分布、数量、质量、结构、特色农作物种植适宜性等资源禀赋特征，为发展富硒特色农业提供基础性数据。同时开展富硒水资源调查，为开发富硒水产品及富硒矿泉水提供基础性数据。
为此，张亚忠建议，一是提高政策优惠及财政资金支持力度，强力推进富硒功能农业标准化示范区建设。创新发展机制，让社会资本和集体经济融入产业发展中，加大龙头企业支持力度，培育并做强一批富硒农产品种植示范基地或生态园工程；同时政府应在土地、税收、资金等方面提供大力支持和优惠政策，建设典型富硒农产品种植示范基地或生态园工程等富硒功能农业标准化示范区。二是制定富硒特色农业发展规划，促进行业健康有序发展。结合当地社会经济及工农业发展规划，依据富硒资源所处交通位置、自然地理及经济条件、土壤水系资源禀赋特征及种植养殖适宜性等，制定富硒特色农业发展规划，科学合理地开发利用富硒资源，优化农业种植结构和富硒农业布局，发展富硒水产品及蛋肉类产业，保障和促进富硒特色农业健康和高质量发展。三是加强富硒产品宣传力度，推进品牌建设。加强硒元素的科普宣传力度，让广大消费者进一步认识到补硒的重要性和富硒产品的市场前景，提高社会资本及农民从事富硒产品种植养殖积极性。加强富硒产品品牌建设，催生一批绿色食品和农产品地理标志及绿色食品证书，在广大消费者群体中树立富硒产品品牌认知度。四是加大科研投入，开辟有机硒获取新途径。研发富硒饲料添加剂和土壤富硒改良剂并产业化，拓展富硒农产品产业链，推动地方经济发展。开辟有机硒获取新途径，改良贫硒土壤，改善农产品营养结构，进一步提高国民饮食健康水平。
