一般情况下翻耕3次，翻耕深度15cm左右，翻耕前加入硫酸钾复合肥20公斤、生物有机肥400斤（或者发酵好的菌糠）。
第一次翻耕，将复合肥、有机肥或者废菌糠和土壤充分混匀，其中硫酸钾复合肥为富硒羊肚菌提供氮磷钾等微量元素，生物有机肥或废菌糠除了提供养分外，还可以改良土壤，增加土壤保水保肥能力。
第二次翻耕前，每亩地用辛硫磷2斤或毒死蜱2斤，兑水喷洒地面，或者药物掺麦麸20斤/亩，搅拌均匀，撒入地面，旋耕一次。
第三次是播种前3-5天内，每亩地使用草木灰400斤，生石灰200斤，旋耕一遍，即可播种。
三次旋耕时间根据当地具体情况而定，一般情况下，第一遍旋耕最好在播种前至少一月进行，每次旋耕间隔最好大于5天。
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一、富硒羊肚菌种植过程中的技术要点
1.把握富硒羊肚菌种植生态条件
为促进富硒羊肚菌在产量与质量方面的双重提高，应牢牢把握富硒羊肚菌种植的适宜生态条件，对温度、湿度、日照强度、土壤酸碱度以及空气含氧量进行严格控制。富硒羊肚菌从属性上来看属于低温高湿型真菌，在仿生态环境时应考虑到富硒羊肚菌的生长周期问题，不仅要给予富硒羊肚菌低温培养环境，还要给予较大的温度差以刺激菌丝体分化。还有研究表明，微弱的散射光有利于富硒羊肚菌的生长发育，为此应严格控制光照强度，中性或弱碱性的土壤环境有利于富硒羊肚菌的健康成长。
2.菌种及种植地的合理选择
菌种的选择应与种植环境高度匹配，当种植户没有自行制种的条件时应到专业生产菌种的地方购买，以确保菌种的质量。在购买时以菌丝粗壮浓密为选择标准，避免其它杂菌污染的菌种混入其中，且尽可能选择红褐色的菌种。
富硒羊肚菌种植地对水源的要求相对较高，其海拔高度应当控制在1600m左右，尽可能选择弱碱性土壤进行种植工作。种植地应当具有较平的地势、清新的空气、清洁的环境以及无污染的水源。
3.土壤预处理及种植棚搭建
土壤预处理的目的是保持土壤最佳状态，从而为菌种的种植工作提供更多支持。针对林地，可施用60kg左右的生石灰以清除害虫并调节土壤酸碱度；耕田，可施用90kg左右的草木灰配以60kg左右生石灰调节土壤酸碱度。在菌种种植前30d开始翻耕土地，将翻好的土壤曝晒10d左右，不仅对消灭土壤中的杂菌及其它有害物质具有重要意义，也能促进富硒羊肚菌的顺利种植。富硒羊肚菌种植最早采用搭棚的方式进行，矮棚（0.75m）在林下种植中的使用比较多，而中棚的搭建只需要维持在2m高左右，要注意，种植棚的搭建对遮阳率的要求较高，应将遮阳率控制在95%左右。
二、播种后营养袋处理要点
应对营养袋的放置进行精细布控，当进入富硒羊肚菌种植的富集阶段后进行营养袋的放置工作。在每个营养袋上划出2个横向小口并使带有开口的那一面与地面土壤接近，使营养袋与白色菌露充分接触，以促进菌丝的快速生长。在进行营养袋安置的过程中，应严格按照40cm间隔且平行摆放的标准，再给予相应的覆膜处理。
营养袋的放置时间应根据种植地的天气情况以及土壤的温度来进行设置，一般维持在40～60d，观察到袋内培养料绝大部分开始感染、变色或看墒表面分生孢子已开始消退时，要及时将袋子全部拣出。当第2次反起的分生孢子还在继续消退时，富硒羊肚菌菌丝已由原先的营养生长转化为生殖生长。应时刻观察菌丝生长情况，保持土壤湿润，等待出菇。出菇时要保持空气湿度，还要保障土壤中的水分，以防止出菇时温度、湿度过高；加强空气的流通，降低湿度、温度，以避免发生病害，保障富硒羊肚菌的品质和产量。
三、综合防治管理技术要点
富硒羊肚菌由于受到跳虫以及菌蚊等多种害虫的影响，其培养过程、产量与质量难以得到保障，为此应适当采取曝晒田地、灯光诱杀害虫以及药物辅助防控等综合防治管理方法对富硒羊肚菌的种植过程进行严格把控。应坚持“预防为主、药防为辅”的原则进行综合管理工作。
在富硒羊肚菌种植工作中应对病虫害的防治给予高度重视，尽可能选择品种优良、菌丝健壮且传代较少的菌种，且将菌龄的选择标准控制在不超过40d，最好将种植时间安排在每年的11—12月，以控制气候因素，始终保持空气含氧量不低于富硒羊肚菌生存标准。在富硒羊肚菌的培养基中加入适量的保菇灵类药品，适当喷洒药物进行杀毒杀虫，以保持种植环境的整洁卫生。为做好预防工作，应在富硒羊肚菌下种后定期喷水，以维持空气湿度与土壤湿度始终处于最佳状态，维持土壤内益生菌含量，以达到抑制病菌滋生的目的。应重视药物灭菌方法的正确使用，根据菌种及种植地实际情况将药物辅助灭菌工作分2次进行，第1次在培养基内进行，第2次可将灭菌药物喷洒在培养基周围与表面，从而达到杀菌消毒的作用，也为富硒羊肚菌种植工作的顺利进行提供强有力的保障。
