植物对硒的吸收是一个主动过程，不同植物对硒的吸收与积聚能力不同，植物中的硒主要以有机硒化合物的形式存在。研究表明，植物根系吸收的无机硒90%以上转化为有机硒。硒在植物体中的主要作用有以下几个方面。
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（1）硒是高等植物生长的必需微量元素，但不是硒非积聚性植物生长的必需微量元素。实验表明，在适宜的浓度下，硒可促进植物的生长，但硒浓度过高会引起植物硒中毒。
（2）硒参与植物中一些低分子量氨基酸和酶的合成。适量的硒进入植物体内后，过氧化物酶的活性则升高，增强了植株的抗氧化能力，对植物的生长、发育和成熟具有重要作用。硒对高等植物具有抗氧化作用，而高等植物具有同化硒的作用。通过同化作用在植物体内合成硒蛋白、含硒蛋白、含硒前及含磷氨据放的衍生物。这一同化途径大致为：硒主要在叶片中经一系列光合作用还步还原，并在半胱氨酸合成酶的作用下，生成硒代半胱氨酸，再由硒代半脱氨酸通过各种途径，在非积聚性植物（如谷物）中生成硒蛋氨酸与合成硒蛋白；而聚硒植物中的硒主要是非蛋白型的含硒氨基酸。
（3）硒在植物体内的存在形式很复杂，部分以含硒氨基酸衍生物的形式存在，硒参与植物中含硒氨基酸衍生物的形成。
（4）硒参与植物体内硒多糖的合成，硒多糖对细胞具有保护作用。
（5）适量的硒促进植物的光合作用。
（6）硒是谷胱甘肽过氧化物酶的组分，谷胱甘肽过氧化物酶有清除自由基、保护生物膜不受损伤的功能。
（7）实验证实，硒有拮抗铅、镉等有毒元素的功能，其机制可能是无机硒以某种方式与有毒元素铅、镉等相结合，从而降低有毒元素对植物的危害。研究还证实，硒对氮、钾有协同作用，对磷则有拮抗作用；硒还对光合作用的强度有抑制作用。
（8）随生育期进程，硒在植物体内可以转移和再分配，由生长前期主要集中在叶片中逐渐向茎秆、叶鞘中转移，最后在籽粒内富集。
所以，硒对植物的产量和质量都有影响。
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